檸檬酸是有機酸中第一大酸，自然界中檸檬酸廣泛存在于檸檬和橙以及桔子等水果中，常溫及空氣中穩定,在濕空氣中微有溶解性,在熱空氣中產生風化現象，由于物理性能和化學性能以及衍生物的性能，是廣泛應用于食品和醫藥以及日化等行業最重要的有機酸。檸檬酸水溶液在溫度大于80℃時其pH小于3，已屬于強酸。細菌的生存都需要一個特定的pH，檸檬酸的酸性可改變細胞內的pH值，影響到細菌的正常代謝。顯酸性的高濃度氫離子也會改變細菌的生物活性，直接傷害到菌體細胞。從而引起細菌的死亡。
熱力也是促進檸檬酸殺芽孢效果的一個重要因素。常溫下檸檬酸并沒有殺芽孢效果，當溫度加熱至大于80℃時，微生物受到熱力的作用，細胞活動加速，并且其芽孢外殼的通透性也會改變，細菌芽孢的胞壁和胞膜也是熱力的重要作用點。在熱力的作用下，檸檬酸溶液的分子運動也會改變，其滲透性也會增強。所以在熱力對芽孢菌體及檸檬酸水溶液的共同作用下，檸檬酸表現出優秀的殺芽孢效果。
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